Rensning af alger ud af kølevand kræver en tilgang, der tager højde for algernes egenskaber og sammensætningen af kølevandet.
I praksis anvendes ofte en forbehandling, efterfulgt af en passende filtrations- eller adskillelsesteknik for effektivt at fjerne alger fra kølevandet.
Ved at overvåge processen nøje og justere den i forhold til koncentration og flow, kan man opnå et stabilt og pålideligt resultat.