Filtrering af alger ud af procesvand kræver en tilgang, der tager højde for algernes egenskaber og sammensætningen af procesvandet.
I praksis anvendes ofte en forbehandling efterfulgt af en passende filtrerings- eller adskillelsesteknik for effektivt at fjerne alger fra procesvandet.
Ved at overvåge processen nøje og tilpasse den til koncentration og flow, kan man opnå et stabilt og pålideligt resultat.