Levän puhdistaminen dieselistä vaatii lähestymistavan, joka vastaa levän ominaisuuksia ja dieselin koostumusta.
Käytännössä käytetään usein esivaihetta, jota seuraa sopiva suodatus- tai erotustekniikka levän tehokkaaksi poistamiseksi dieselistä.
Hyvin valvotun prosessin ja pitoisuuden sekä virtausnopeuden säätämisen avulla voidaan saavuttaa vakaa ja luotettava tulos.