Rensning af alger ud af opvarmningsvandet kræver en tilgang, der tager højde for algens egenskaber og sammensætningen af opvarmningsvandet.
I praksis anvendes ofte et forarbejde, efterfulgt af en passende filtrations- eller separationsmetode for effektivt at fjerne alger fra opvarmningsvandet.
Ved at overvåge processen nøje og tilpasse den til koncentration og flow, kan man opnå et stabilt og pålideligt resultat.